Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms