Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms