Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms