Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms