Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms