Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca2P97929 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms