Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AlkP97793 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AlkP97793 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AlkP97793 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AlkP97793 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlkP97793 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlkP97793 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlkP97793 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlkP97793 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlkP97793 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlkP97793 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlkP97793 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlkP97793 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlkP97793 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlkP97793 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlkP97793 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlkP97793 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlkP97793 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AlkP97793 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms