Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gata5P97489 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms