Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps45P97390 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms