Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim43bP86448 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms