Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms