Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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