Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux2P70298 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux2P70298 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux2P70298 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms