Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms