Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms