Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig1P70193 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms