Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4bP68372 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb4bP68372 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms