Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms