Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crabp1P62965 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms