Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f4P62515 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms