Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms