Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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