Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms