Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Depdc5P61460 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Depdc5P61460 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Depdc5P61460 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Depdc5P61460 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms