Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd6P61407 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms