Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf1P61148 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf1P61148 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms