Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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