Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap25P60879 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms