Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp4P59240 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms