Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms