Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms