Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms