Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms