Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpa1P57784 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms