Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms