Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms