Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5bP56480 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5bP56480 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms