Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtskP55097 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtskP55097 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtskP55097 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtskP55097 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtskP55097 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtskP55097 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms