Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms