Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms