Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms