Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna1P52793 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna1P52793 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms