Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClgnP52194 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClgnP52194 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms