Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Defa6P50704 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms