Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FmodP50608 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FmodP50608 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FmodP50608 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms