Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl5P50228 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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