Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms