Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms