Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms