Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GdnfP48540 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GdnfP48540 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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